A microbiota intestinal é um modulador chave da imunidade do hospedeiro, em parte por meio da produção de lipídios e metabólitos bacterianos estruturalmente diversos e em grande parte ainda não caracterizados, com propriedades imunorreguladoras potenciais. Usando um modelo de camundongo gnotobiótico Oligo-Mouse-Microbiota (OMM¹²) infectado com o patógeno Citrobacter rodentium, investigamos as alterações metabolômicas associadas à colite.