Os lisossomos são organelas integrais que comunicam o status celular a um tecido inteiro por meio de mecanismos mal definidos. Aqui, desenvolvemos uma plataforma imparcial, integrando os metabolomas do plasma humano e a metabolômica de um único lisossoma, e mostramos que os subprodutos da proteólise são uma classe inesperada de moléculas sinalizadoras.